Las hojas miden entre 2 y 3 pulgadas de largo, tienen forma de abanico y, a menudo, tienen dos lóbulos (el epíteto específico "biloba" hace referencia a esto). Las hojas tienen una sensación como de cuero con llamativas venas divergentes que parecen casi paralelas. Las hojas muestran una disposición alternativa que emergen de "brotes cortos" nudosos. En la primavera, las hojas son de un verde amarillo brillante, pasando a un hermoso color amarillo dorado en otoño.

Las flores son pequeñas y discretas con flores masculinas y femeninas en árboles separados (dioicas). Los árboles masculinos producen amentos colgantes (1 pulgada) que proporcionan polen para las flores con pistilos colgantes (1,5 a 2 pulgadas) en los árboles hembras (marzo-abril).

Los ginkgos son dioicos, lo que significa que hay árboles masculinos y femeninos. Aunque no es una verdadera fruta, los árboles femeninos producen una semilla con una cubierta carnosa. Tienen forma ovalada, aparecen de color naranja tostado con un molde plateado y cuelgan de los brotes de espuela. Curiosamente, el nombre del género es una interpretación errónea del japonés "gin" que significa plata y "kyo" que significa albaricoque utilizado en Japón en el siglo XVII. A menudo producidos en gran abundancia, los árboles hembras en septiembre y octubre, hacen un desastre pues tiran muchos frutos que tienen un olor fuerte y picante. Por esta razón, ahora se prefieren los cultivos masculinos.

La corteza es típicamente de color café grisáceo claro, con crestas y surcos poco profundos, que eventualmente se hacen más profundas con la edad.